基础医学与法医学院学生管理机构健全，由一名专职副院长分管学生工作。设有学生管理科、团总支和学生党支部。
基础医学与法医学学院学生管理科成立于2006年，学生管理科现配有学生管理正副科长各一名，每班配有兼职班主任，现有专兼职班主任23名，其中博士4名，硕士17名。现管理临床专业本科、法医专业本科、民族预科等专业1-3年级学生2148人。
基础医学与法医学院现有团支部52个，团员2107人，党员47人。现有专职团总支书记1名，学生岗团总支副书记2名，团总支委员13名。每学年有200名团员填写“优秀团员入党推荐表”，90人通过党课培训，48人发展为预备党员。学生会设7个部门，主席团设立主席1名、副主席3名、各部门均设立正、副部长各一名，干事若干。
1人获“2011全国高校辅导员年度人物”评选活动中获入围奖、中国卫生思想政治工作促进会医学教育分会“优秀学生辅导员”、 包头市优秀班主任；3人获自治区高校优秀班主任荣誉称号。1人获全区优秀共青团干。
2012-2014年，6名学生获得国家奖学金，141名获国家励志奖学金。
2012-2014年，获自治区级三好学生55人、优秀学生干部53人、优秀毕业生9人，校级先进班集体9个。
1名学生获2013内蒙古年度大学生“桃李之星”提名奖， 1项获“自治区第一届大学生创业大赛”优秀奖，1名学生获2012包头市“大学生形象大使”选拔赛二等奖,在包头市首届大学生跆拳道比赛、自治区第十三届运动会、全区高校校园好声音大赛等赛事中取得优异成绩。
班主任发表学生管理类论文10余篇。其中1篇获得高教部思政教育3等奖。
2012、2013年获包头医学院共青团工作实绩优秀单位
2013年获包头医学院运动会道德风尚奖
2012年获包头五四红旗团支部荣誉称号
2013、2014获得包头医学院“挑战杯”优秀组织奖
（供稿单位：未知）